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Pythonでの統計解析、バイオインフォマティクス…。現代の医学研究では、WindowsやMacよりもLinux環境が有利な場面が増えています。 しかし、そのためだけに高価な新しいPCを用意するのは、コスト面で躊躇われるかもしれません。 この記事では、中古で安価...

膨大な臨床データの統計解析、引用文献リストのフォーマット整理、そして、日々の業務を自動化する、ちょっとしたツールの作成…。 我々医師・研究者の仕事は、本来の「考察」や「診断」といった、高度な知的作業以外の、退屈で、時間のかかる“作業”に、あ...

研究用のLinuxマシンに、あなたのKindleライブラリを同期させたい。 しかし、Amazonは公式なLinux版アプリを提供していません。ブラウザ版のCloud Readerは便利ですが、オフラインでは使えず、文献としての使い勝手もいまひとつです。 この記事では、研究...

メタアナリシスのため、何十もの先行研究論文の「結果の表」を、ひたすら手作業でExcelに転記する…。 この、時間と集中力を浪費する、非創造的な作業にうんざりしていませんか？ 実は、このプロセスはPythonを使えば、数分で自動化できます。 この記事では...

「データは、全てクラウドに保存すれば良い」 現代では、それが、あたかも唯一の正解であるかのように語られます。しかし、我々医師・研究者が扱うデータは、その性質が全く異なります。 匿名化された、しかし、機密性の高い臨床データ。数百GBに及ぶ、医...

系統的レビューや論文執筆の際、何百ものPubMedや先行研究のURLリストを前に、途方に暮れた経験はありませんか？ 一つひとつ手作業でハイパーリンク化し、内容を確認するのは、我々の貴重な研究時間を浪費する、非効率な作業です。 この記事では、多くの先...

共同研究者から送られてきた、貴重なデータが入ったCSVファイル。 早速pandasで読み込もうとした瞬間、赤いエラーメッセージが表示され、解析が止まってしまう…。 特に「pandas.errors.ParserError: Expected xx fields...」は、手作業で編集された、”きれ...