医学研究とデータサイエンス– category –

「Excelのハイパーリンク付き資料をPDFにしたら、リンクが使えなくなった…」そんな経験ありませんか？ 本記事では、Excelで作成したハイパーリンク付きデータを“そのままPDF化”し、インタラクティブな資料に仕上げる方法をステップごとに丁寧に解説します...

医局の共有フォルダに置いたマニュアル一覧や、共同研究者に送った文献リストのExcel。せっかくPDFへのリンクを丁寧に貼ったのに、「先生、リンク先のファイルが開けません（エラーになります）」と言われて、再設定に時間を奪われた経験はありませんか？ ...

日常の臨床業務や研究活動において、専門書や最新の医学論文、電子書籍（Kindle）から必要な図表・記述をキャプチャし、文献管理ソフトやノートアプリに整理する作業は日常茶飯事です。 しかし、「ページをめくり、スクショを撮り、トリミングして保存する...

学会発表のスライドに、医学書の決定的な図表を引用したい。しかしKindle版は直接画像のコピーができないため、「スクリーンショットを撮ってスライドに貼り付ければ良いのでは」と考えたことはないでしょうか。 その行為は、実は極めて大きな法的・契約的...

「データは、全てクラウドに保存すれば良い」 現代では、それが、あたかも唯一の正解であるかのように語られます。しかし、我々医師・研究者が扱うデータは、その性質が全く異なります。 匿名化された、しかし、機密性の高い臨床データ。数百GBに及ぶ、医...

診療ガイドラインの比較検討、あるいは最新論文のサーベイ。 我々の業務では、一度に数十のウェブページを参照したい場面が頻繁にあります。 しかし、リンクを一つひとつクリックしてタブを開く作業は、貴重な思考のリズムを妨げる、単純ながらも大きなス...

系統的レビューのために集めた、何百ものPubMedのURLリスト。 Webからコピー＆ペーストした、膨大な量の先行研究データ。 それらが、青い文字と下線だらけになり、「どこをクリックしても、意図せずブラウザが起動する」という、ストレスフルな状態になっ...

系統的レビューや論文執筆の際、何百ものPubMedや先行研究のURLリストを前に、途方に暮れた経験はありませんか？ 一つひとつ手作業でハイパーリンク化し、内容を確認するのは、我々の貴重な研究時間を浪費する、非効率な作業です。 この記事では、多くの先...

共同研究者から送られてきた、貴重なデータが入ったCSVファイル。 早速pandasで読み込もうとした瞬間、赤いエラーメッセージが表示され、解析が止まってしまう…。 特に「pandas.errors.ParserError: Expected xx fields...」は、手作業で編集された、”きれ...

「Pythonで、統計解析を、始めてみたい」 「機械学習で、新しい、診断モデルを、作ってみたい」 そう、志した、多くの、多忙な医師が、その、最初の、たった、一歩で、挫折します。 「環境構築」という、意味不明で、時間のかかる、あまりにも、高い、壁。...